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Afin de rapprocher au mieux les programmes de recherche des besoins des utilisateurs, l'IRSAT s'est engagé dans un processus de décentralisation de ses activités. Ainsi, une Direction régionale a été créée pour la région Ouest du pays et est basée à Bobo-Dioulasso. La plupart des départements scientifiques y sont représentés ; en particulier, un laboratoire d'analyses microbiologiques y est installé en vue de répondre aux besoins des nombreuses entreprises agroalimentaires locales
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